阿縫(中田青渚飾)對自己居住的長屋被稱為“好人長屋”感到一種說不出的不自在。因為，表面上是一副好人模樣的大雜院居民，實際上都是與表面工作不同的小壞蛋。扒手、欺詐師、美人局、小偷、偽作師、地下社會的情報販子……這里是和“善人長屋”的外號完全相反的長屋。

真正的好人·加助(溝端淳平)混進了這樣的長屋，引發了許多騷動!以幫助他人為人生價值的加助，發現町中有困難的人，就會向好人長屋的房客請求幫助。阿縫的父親，長屋的首領·儀右衛門(吉田鋼太郎)感到很困惑，但阿縫卻不知為何積極幫助別人，并搭上了加助的船。在阿縫的母親·阿俊(高島禮子)的斡旋下，以儀右衛門為首的長屋里的小壞蛋們，雖然不情愿，但還是發揮了自己從事地下工作的厲害本領，開始幫助別人。

另一方面，加助雖然有因火災失去妻子和女兒的過去，但知道其實二人還活著···。