恐怖組織“瓦干布”滲透香港，在香港掀起一場化武爭奪戰，飛虎隊總指揮范少鋒（陳豪 飾）臨危受命，率飛虎隊與恐怖分子斗智斗勇。飛虎隊身陷瓦干布的無情殺局，特勤隊警司展博文（馬德鐘 飾）召集警界精英張偉樺（張兆輝 飾）、張嘉軒（黃宗澤 飾）和高子樂（吳卓羲 飾）成立秘密反恐小組S Team。面對重重危機，在國際刑警許俊飛（苗僑偉 飾）的協助下，中青兩代最終放下恩怨情仇，聯手阻止化武病毒在香港蔓延。